The ENCODE (ENCyclopedia of DNA Elements) Project

E. A. Feingold; P. J. Good; M. S. Guyer; S. Kamholz; L. Liefer; K. Wetterstrand; F. S. Collins; T. R. Gingeras; D. Kampa; E. A. Sekinger; J. Cheng; H. Hirsch; S. Ghosh; Z. Zhu; S. Patel; A. Piccolboni; A. Yang; H. Tammana; S. Bekiranov; P. Kapranov; R. Harrison; G. Church; K. Struhl; B. Ren; T. H. Kim; L. O. Barrera; C. Qu; S. van Calcar; R. Luna; C. K. Glass; M. G. Rosenfeld; R. Guigo; S. E. Antonarakis; E. Birney; M. Brent; L. Pachter; A. Reymond; E. T. Dermitzakis; C. Dewey; D. Keefe; F. Denoeud; J. Lagarde; J. Ashurst; T. Hubbard; J. J. Wesselink; R. Castelo; E. Eyras; R. M. Myers; A. Sidow; S. Batzoglou; N. D. Trinklein; S. J. Hartman; S. F. Aldred; E. Anton; D. I. Schroeder; S. S. Marticke; L. Nguyen; J. Schmutz; J. Grimwood; M. Dickson; G. M. Cooper; E. A. Stone; G. Asimenos; M. Brudno; A. Dutta; N. Karnani; C. M. Taylor; H. K. Kim; G. Robins; G. Stamatoyannopoulos; J. A. Stamatoyannopoulos; M. Dorschner; P. Sabo; M. Hawrylycz; R. Humbert; J. Wallace; M. Yu; P. A. Navas; M. McArthur; W. S. Noble; I. Dunham; C. M. Koch; R. M. Andrews; G. K. Clelland; S. Wilcox; J. C. Fowler; K. D. James; P. Groth; O. M. Dovey; P. D. Ellis; V. L. Wraight; A. J. Mungall; P. Dhami; H. Fiegler; C. F. Langford; N. P. Carter; D. Vetrie; M. Snyder; G. Euskirchen; A. E. Urban; U. Nagalakshmi; J. Rinn; G. Popescu; P. Bertone; S. Hartman; J. Rozowsky; O. Emanuelsson; T. Royce; S. Chung; M. Gerstein; Z. Lian; J. Lian; Y. Nakayama; S. Weissman; V. Stolc; W. Tongprasit; H. Sethi; S. Jones; M. Marra; H. Shin; J. Schein; M. Clamp; K. Lindblad-Toh; J. Chang; D. B. Jaffe; M. Kamal; E. S. Lander; T. S. Mikkelsen; J. Vinson; M. C. Zody; P. J. de Jong; K. Osoegawa; M. Nefedov; B. Zhu; A. D. Baxevanis; T. G. Wolfsberg; G. E. Crawford; J. Whittle; I. E. Holt; T. J. Vasicek; D. Zhou; S. Luo; E. D. Green; G. G. Bouffard; E. H. Margulies; M. E. Portnoy; N. F. Hansen; P. J. Thomas; J. C. McDowell; B. Maskeri; A. C. Young; J. R. Idol; R. W. Blakesley; G. Schuler; W. Miller; R. Hardison; L. Elnitski; P. Shah; S. L. Salzberg; M. Pertea; W. H. Majoros; D. Haussler; D. Thomas; K. R. Rosenbloom; H. Clawson; A. Siepel; W. J. Kent; Z. Weng; S. Jin; A. Halees; H. Burden; U. Karaoz; Y. Fu; Y. Yu; C. Ding; C. R. Cantor; R. E. Kingston; J. Dennis; R. D. Green; M. A. Singer; T. A. Richmond; J. E. Norton; P. J. Farnham; M. J. Oberley; D. R. Inman; M. R. McCormick; H. Kim; C. L. Middle; M. C. Pirrung; X. D. Fu; Y. S. Kwon; Z. Ye; J. Dekker; T. M. Tabuchi; N. Gheldof; J. Dostie; S. C. Harvey

doi:10.1126/science.1105136

The ENCODE (ENCyclopedia of DNA Elements) Project

E. A. Feingold, P. J. Good, M. S. Guyer, S. Kamholz, L. Liefer, K. Wetterstrand, F. S. Collins, T. R. Gingeras, D. Kampa, E. A. Sekinger, J. Cheng, H. Hirsch, S. Ghosh, Z. Zhu, S. Patel, A. Piccolboni, A. Yang, H. Tammana, S. Bekiranov, P. KapranovR. Harrison, G. Church, K. Struhl, B. Ren, T. H. Kim, L. O. Barrera, C. Qu, S. van Calcar, R. Luna, C. K. Glass, M. G. Rosenfeld, R. Guigo, S. E. Antonarakis, E. Birney, M. Brent, L. Pachter, A. Reymond, E. T. Dermitzakis, C. Dewey, D. Keefe, F. Denoeud, J. Lagarde, J. Ashurst, T. Hubbard, J. J. Wesselink, R. Castelo, E. Eyras, R. M. Myers, A. Sidow, S. Batzoglou, N. D. Trinklein, S. J. Hartman, S. F. Aldred, E. Anton, D. I. Schroeder, S. S. Marticke, L. Nguyen, J. Schmutz, J. Grimwood, M. Dickson, G. M. Cooper, E. A. Stone, G. Asimenos, M. Brudno, A. Dutta, N. Karnani, C. M. Taylor, H. K. Kim, G. Robins, G. Stamatoyannopoulos, J. A. Stamatoyannopoulos, M. Dorschner, P. Sabo, M. Hawrylycz, R. Humbert, J. Wallace, M. Yu, P. A. Navas, M. McArthur, W. S. Noble, I. Dunham, C. M. Koch, R. M. Andrews, G. K. Clelland, S. Wilcox, J. C. Fowler, K. D. James, P. Groth, O. M. Dovey, P. D. Ellis, V. L. Wraight, A. J. Mungall, P. Dhami, H. Fiegler, C. F. Langford, N. P. Carter, D. Vetrie, M. Snyder, G. Euskirchen, A. E. Urban, U. Nagalakshmi, J. Rinn, G. Popescu, P. Bertone, S. Hartman, J. Rozowsky, O. Emanuelsson, T. Royce, S. Chung, M. Gerstein, Z. Lian, J. Lian, Y. Nakayama, S. Weissman, V. Stolc, W. Tongprasit, H. Sethi, S. Jones, M. Marra, H. Shin, J. Schein, M. Clamp, K. Lindblad-Toh, J. Chang, D. B. Jaffe, M. Kamal, E. S. Lander, T. S. Mikkelsen, J. Vinson, M. C. Zody, P. J. de Jong, K. Osoegawa, M. Nefedov, B. Zhu, A. D. Baxevanis, T. G. Wolfsberg, G. E. Crawford, J. Whittle, I. E. Holt, T. J. Vasicek, D. Zhou, S. Luo, E. D. Green, G. G. Bouffard, E. H. Margulies, M. E. Portnoy, N. F. Hansen, P. J. Thomas, J. C. McDowell, B. Maskeri, A. C. Young, J. R. Idol, R. W. Blakesley, G. Schuler, W. Miller, R. Hardison, L. Elnitski, P. Shah, S. L. Salzberg, M. Pertea, W. H. Majoros, D. Haussler, D. Thomas, K. R. Rosenbloom, H. Clawson, A. Siepel, W. J. Kent, Z. Weng, S. Jin, A. Halees, H. Burden, U. Karaoz, Y. Fu, Y. Yu, C. Ding, C. R. Cantor, R. E. Kingston, J. Dennis, R. D. Green, M. A. Singer, T. A. Richmond, J. E. Norton, P. J. Farnham, M. J. Oberley, D. R. Inman, M. R. McCormick, H. Kim, C. L. Middle, M. C. Pirrung, X. D. Fu, Y. S. Kwon, Z. Ye, J. Dekker, T. M. Tabuchi, N. Gheldof, J. Dostie, S. C. Harvey

Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

1572 Citations (SciVal)

Abstract

The ENCyclopedia Of DNA Elements (ENCODE) Project aims to identify all functional elements in the human genome sequence. The pilot phase of the Project is focused on a specified 30 megabases (∼1%) of the human genome sequence and is organized as an international consortium of computational and laboratory-based scientists working to develop and apply high-throughput approaches for detecting all sequence elements that confer biological function. The results of this pilot phase will guide future efforts to analyze the entire human genome.

Original language	English (US)
Pages (from-to)	636-640
Number of pages	5
Journal	Science
Volume	306
Issue number	5696
DOIs	https://doi.org/10.1126/science.1105136
State	Published - Oct 22 2004

All Science Journal Classification (ASJC) codes

General

Access to Document

10.1126/science.1105136

Cite this

Feingold, E. A., Good, P. J., Guyer, M. S., Kamholz, S., Liefer, L., Wetterstrand, K., Collins, F. S., Gingeras, T. R., Kampa, D., Sekinger, E. A., Cheng, J., Hirsch, H., Ghosh, S., Zhu, Z., Patel, S., Piccolboni, A., Yang, A., Tammana, H., Bekiranov, S., ... Harvey, S. C. (2004). The ENCODE (ENCyclopedia of DNA Elements) Project. Science, 306(5696), 636-640. https://doi.org/10.1126/science.1105136

Feingold, E. A. ; Good, P. J. ; Guyer, M. S. ; Kamholz, S. ; Liefer, L. ; Wetterstrand, K. ; Collins, F. S. ; Gingeras, T. R. ; Kampa, D. ; Sekinger, E. A. ; Cheng, J. ; Hirsch, H. ; Ghosh, S. ; Zhu, Z. ; Patel, S. ; Piccolboni, A. ; Yang, A. ; Tammana, H. ; Bekiranov, S. ; Kapranov, P. ; Harrison, R. ; Church, G. ; Struhl, K. ; Ren, B. ; Kim, T. H. ; Barrera, L. O. ; Qu, C. ; van Calcar, S. ; Luna, R. ; Glass, C. K. ; Rosenfeld, M. G. ; Guigo, R. ; Antonarakis, S. E. ; Birney, E. ; Brent, M. ; Pachter, L. ; Reymond, A. ; Dermitzakis, E. T. ; Dewey, C. ; Keefe, D. ; Denoeud, F. ; Lagarde, J. ; Ashurst, J. ; Hubbard, T. ; Wesselink, J. J. ; Castelo, R. ; Eyras, E. ; Myers, R. M. ; Sidow, A. ; Batzoglou, S. ; Trinklein, N. D. ; Hartman, S. J. ; Aldred, S. F. ; Anton, E. ; Schroeder, D. I. ; Marticke, S. S. ; Nguyen, L. ; Schmutz, J. ; Grimwood, J. ; Dickson, M. ; Cooper, G. M. ; Stone, E. A. ; Asimenos, G. ; Brudno, M. ; Dutta, A. ; Karnani, N. ; Taylor, C. M. ; Kim, H. K. ; Robins, G. ; Stamatoyannopoulos, G. ; Stamatoyannopoulos, J. A. ; Dorschner, M. ; Sabo, P. ; Hawrylycz, M. ; Humbert, R. ; Wallace, J. ; Yu, M. ; Navas, P. A. ; McArthur, M. ; Noble, W. S. ; Dunham, I. ; Koch, C. M. ; Andrews, R. M. ; Clelland, G. K. ; Wilcox, S. ; Fowler, J. C. ; James, K. D. ; Groth, P. ; Dovey, O. M. ; Ellis, P. D. ; Wraight, V. L. ; Mungall, A. J. ; Dhami, P. ; Fiegler, H. ; Langford, C. F. ; Carter, N. P. ; Vetrie, D. ; Snyder, M. ; Euskirchen, G. ; Urban, A. E. ; Nagalakshmi, U. ; Rinn, J. ; Popescu, G. ; Bertone, P. ; Hartman, S. ; Rozowsky, J. ; Emanuelsson, O. ; Royce, T. ; Chung, S. ; Gerstein, M. ; Lian, Z. ; Lian, J. ; Nakayama, Y. ; Weissman, S. ; Stolc, V. ; Tongprasit, W. ; Sethi, H. ; Jones, S. ; Marra, M. ; Shin, H. ; Schein, J. ; Clamp, M. ; Lindblad-Toh, K. ; Chang, J. ; Jaffe, D. B. ; Kamal, M. ; Lander, E. S. ; Mikkelsen, T. S. ; Vinson, J. ; Zody, M. C. ; de Jong, P. J. ; Osoegawa, K. ; Nefedov, M. ; Zhu, B. ; Baxevanis, A. D. ; Wolfsberg, T. G. ; Crawford, G. E. ; Whittle, J. ; Holt, I. E. ; Vasicek, T. J. ; Zhou, D. ; Luo, S. ; Green, E. D. ; Bouffard, G. G. ; Margulies, E. H. ; Portnoy, M. E. ; Hansen, N. F. ; Thomas, P. J. ; McDowell, J. C. ; Maskeri, B. ; Young, A. C. ; Idol, J. R. ; Blakesley, R. W. ; Schuler, G. ; Miller, W. ; Hardison, R. ; Elnitski, L. ; Shah, P. ; Salzberg, S. L. ; Pertea, M. ; Majoros, W. H. ; Haussler, D. ; Thomas, D. ; Rosenbloom, K. R. ; Clawson, H. ; Siepel, A. ; Kent, W. J. ; Weng, Z. ; Jin, S. ; Halees, A. ; Burden, H. ; Karaoz, U. ; Fu, Y. ; Yu, Y. ; Ding, C. ; Cantor, C. R. ; Kingston, R. E. ; Dennis, J. ; Green, R. D. ; Singer, M. A. ; Richmond, T. A. ; Norton, J. E. ; Farnham, P. J. ; Oberley, M. J. ; Inman, D. R. ; McCormick, M. R. ; Kim, H. ; Middle, C. L. ; Pirrung, M. C. ; Fu, X. D. ; Kwon, Y. S. ; Ye, Z. ; Dekker, J. ; Tabuchi, T. M. ; Gheldof, N. ; Dostie, J. ; Harvey, S. C. / The ENCODE (ENCyclopedia of DNA Elements) Project. In: Science. 2004 ; Vol. 306, No. 5696. pp. 636-640.

@article{66e157ca439240fdb58df323935af45b,

title = "The ENCODE (ENCyclopedia of DNA Elements) Project",

abstract = "The ENCyclopedia Of DNA Elements (ENCODE) Project aims to identify all functional elements in the human genome sequence. The pilot phase of the Project is focused on a specified 30 megabases (∼1%) of the human genome sequence and is organized as an international consortium of computational and laboratory-based scientists working to develop and apply high-throughput approaches for detecting all sequence elements that confer biological function. The results of this pilot phase will guide future efforts to analyze the entire human genome.",

author = "Feingold, {E. A.} and Good, {P. J.} and Guyer, {M. S.} and S. Kamholz and L. Liefer and K. Wetterstrand and Collins, {F. S.} and Gingeras, {T. R.} and D. Kampa and Sekinger, {E. A.} and J. Cheng and H. Hirsch and S. Ghosh and Z. Zhu and S. Patel and A. Piccolboni and A. Yang and H. Tammana and S. Bekiranov and P. Kapranov and R. Harrison and G. Church and K. Struhl and B. Ren and Kim, {T. H.} and Barrera, {L. O.} and C. Qu and {van Calcar}, S. and R. Luna and Glass, {C. K.} and Rosenfeld, {M. G.} and R. Guigo and Antonarakis, {S. E.} and E. Birney and M. Brent and L. Pachter and A. Reymond and Dermitzakis, {E. T.} and C. Dewey and D. Keefe and F. Denoeud and J. Lagarde and J. Ashurst and T. Hubbard and Wesselink, {J. J.} and R. Castelo and E. Eyras and Myers, {R. M.} and A. Sidow and S. Batzoglou and Trinklein, {N. D.} and Hartman, {S. J.} and Aldred, {S. F.} and E. Anton and Schroeder, {D. I.} and Marticke, {S. S.} and L. Nguyen and J. Schmutz and J. Grimwood and M. Dickson and Cooper, {G. M.} and Stone, {E. A.} and G. Asimenos and M. Brudno and A. Dutta and N. Karnani and Taylor, {C. M.} and Kim, {H. K.} and G. Robins and G. Stamatoyannopoulos and Stamatoyannopoulos, {J. A.} and M. Dorschner and P. Sabo and M. Hawrylycz and R. Humbert and J. Wallace and M. Yu and Navas, {P. A.} and M. McArthur and Noble, {W. S.} and I. Dunham and Koch, {C. M.} and Andrews, {R. M.} and Clelland, {G. K.} and S. Wilcox and Fowler, {J. C.} and James, {K. D.} and P. Groth and Dovey, {O. M.} and Ellis, {P. D.} and Wraight, {V. L.} and Mungall, {A. J.} and P. Dhami and H. Fiegler and Langford, {C. F.} and Carter, {N. P.} and D. Vetrie and M. Snyder and G. Euskirchen and Urban, {A. E.} and U. Nagalakshmi and J. Rinn and G. Popescu and P. Bertone and S. Hartman and J. Rozowsky and O. Emanuelsson and T. Royce and S. Chung and M. Gerstein and Z. Lian and J. Lian and Y. Nakayama and S. Weissman and V. Stolc and W. Tongprasit and H. Sethi and S. Jones and M. Marra and H. Shin and J. Schein and M. Clamp and K. Lindblad-Toh and J. Chang and Jaffe, {D. B.} and M. Kamal and Lander, {E. S.} and Mikkelsen, {T. S.} and J. Vinson and Zody, {M. C.} and {de Jong}, {P. J.} and K. Osoegawa and M. Nefedov and B. Zhu and Baxevanis, {A. D.} and Wolfsberg, {T. G.} and Crawford, {G. E.} and J. Whittle and Holt, {I. E.} and Vasicek, {T. J.} and D. Zhou and S. Luo and Green, {E. D.} and Bouffard, {G. G.} and Margulies, {E. H.} and Portnoy, {M. E.} and Hansen, {N. F.} and Thomas, {P. J.} and McDowell, {J. C.} and B. Maskeri and Young, {A. C.} and Idol, {J. R.} and Blakesley, {R. W.} and G. Schuler and W. Miller and R. Hardison and L. Elnitski and P. Shah and Salzberg, {S. L.} and M. Pertea and Majoros, {W. H.} and D. Haussler and D. Thomas and Rosenbloom, {K. R.} and H. Clawson and A. Siepel and Kent, {W. J.} and Z. Weng and S. Jin and A. Halees and H. Burden and U. Karaoz and Y. Fu and Y. Yu and C. Ding and Cantor, {C. R.} and Kingston, {R. E.} and J. Dennis and Green, {R. D.} and Singer, {M. A.} and Richmond, {T. A.} and Norton, {J. E.} and Farnham, {P. J.} and Oberley, {M. J.} and Inman, {D. R.} and McCormick, {M. R.} and H. Kim and Middle, {C. L.} and Pirrung, {M. C.} and Fu, {X. D.} and Kwon, {Y. S.} and Z. Ye and J. Dekker and Tabuchi, {T. M.} and N. Gheldof and J. Dostie and Harvey, {S. C.}",

year = "2004",

month = oct,

day = "22",

doi = "10.1126/science.1105136",

language = "English (US)",

volume = "306",

pages = "636--640",

journal = "Science",

issn = "0036-8075",

publisher = "American Association for the Advancement of Science",

number = "5696",

}

Feingold, EA, Good, PJ, Guyer, MS, Kamholz, S, Liefer, L, Wetterstrand, K, Collins, FS, Gingeras, TR, Kampa, D, Sekinger, EA, Cheng, J, Hirsch, H, Ghosh, S, Zhu, Z, Patel, S, Piccolboni, A, Yang, A, Tammana, H, Bekiranov, S, Kapranov, P, Harrison, R, Church, G, Struhl, K, Ren, B, Kim, TH, Barrera, LO, Qu, C, van Calcar, S, Luna, R, Glass, CK, Rosenfeld, MG, Guigo, R, Antonarakis, SE, Birney, E, Brent, M, Pachter, L, Reymond, A, Dermitzakis, ET, Dewey, C, Keefe, D, Denoeud, F, Lagarde, J, Ashurst, J, Hubbard, T, Wesselink, JJ, Castelo, R, Eyras, E, Myers, RM, Sidow, A, Batzoglou, S, Trinklein, ND, Hartman, SJ, Aldred, SF, Anton, E, Schroeder, DI, Marticke, SS, Nguyen, L, Schmutz, J, Grimwood, J, Dickson, M, Cooper, GM, Stone, EA, Asimenos, G, Brudno, M, Dutta, A, Karnani, N, Taylor, CM, Kim, HK, Robins, G, Stamatoyannopoulos, G, Stamatoyannopoulos, JA, Dorschner, M, Sabo, P, Hawrylycz, M, Humbert, R, Wallace, J, Yu, M, Navas, PA, McArthur, M, Noble, WS, Dunham, I, Koch, CM, Andrews, RM, Clelland, GK, Wilcox, S, Fowler, JC, James, KD, Groth, P, Dovey, OM, Ellis, PD, Wraight, VL, Mungall, AJ, Dhami, P, Fiegler, H, Langford, CF, Carter, NP, Vetrie, D, Snyder, M, Euskirchen, G, Urban, AE, Nagalakshmi, U, Rinn, J, Popescu, G, Bertone, P, Hartman, S, Rozowsky, J, Emanuelsson, O, Royce, T, Chung, S, Gerstein, M, Lian, Z, Lian, J, Nakayama, Y, Weissman, S, Stolc, V, Tongprasit, W, Sethi, H, Jones, S, Marra, M, Shin, H, Schein, J, Clamp, M, Lindblad-Toh, K, Chang, J, Jaffe, DB, Kamal, M, Lander, ES, Mikkelsen, TS, Vinson, J, Zody, MC, de Jong, PJ, Osoegawa, K, Nefedov, M, Zhu, B, Baxevanis, AD, Wolfsberg, TG, Crawford, GE, Whittle, J, Holt, IE, Vasicek, TJ, Zhou, D, Luo, S, Green, ED, Bouffard, GG, Margulies, EH, Portnoy, ME, Hansen, NF, Thomas, PJ, McDowell, JC, Maskeri, B, Young, AC, Idol, JR, Blakesley, RW, Schuler, G, Miller, W, Hardison, R, Elnitski, L, Shah, P, Salzberg, SL, Pertea, M, Majoros, WH, Haussler, D, Thomas, D, Rosenbloom, KR, Clawson, H, Siepel, A, Kent, WJ, Weng, Z, Jin, S, Halees, A, Burden, H, Karaoz, U, Fu, Y, Yu, Y, Ding, C, Cantor, CR, Kingston, RE, Dennis, J, Green, RD, Singer, MA, Richmond, TA, Norton, JE, Farnham, PJ, Oberley, MJ, Inman, DR, McCormick, MR, Kim, H, Middle, CL, Pirrung, MC, Fu, XD, Kwon, YS, Ye, Z, Dekker, J, Tabuchi, TM, Gheldof, N, Dostie, J & Harvey, SC 2004, 'The ENCODE (ENCyclopedia of DNA Elements) Project', Science, vol. 306, no. 5696, pp. 636-640. https://doi.org/10.1126/science.1105136

The ENCODE (ENCyclopedia of DNA Elements) Project. / Feingold, E. A.; Good, P. J.; Guyer, M. S.; Kamholz, S.; Liefer, L.; Wetterstrand, K.; Collins, F. S.; Gingeras, T. R.; Kampa, D.; Sekinger, E. A.; Cheng, J.; Hirsch, H.; Ghosh, S.; Zhu, Z.; Patel, S.; Piccolboni, A.; Yang, A.; Tammana, H.; Bekiranov, S.; Kapranov, P.; Harrison, R.; Church, G.; Struhl, K.; Ren, B.; Kim, T. H.; Barrera, L. O.; Qu, C.; van Calcar, S.; Luna, R.; Glass, C. K.; Rosenfeld, M. G.; Guigo, R.; Antonarakis, S. E.; Birney, E.; Brent, M.; Pachter, L.; Reymond, A.; Dermitzakis, E. T.; Dewey, C.; Keefe, D.; Denoeud, F.; Lagarde, J.; Ashurst, J.; Hubbard, T.; Wesselink, J. J.; Castelo, R.; Eyras, E.; Myers, R. M.; Sidow, A.; Batzoglou, S.; Trinklein, N. D.; Hartman, S. J.; Aldred, S. F.; Anton, E.; Schroeder, D. I.; Marticke, S. S.; Nguyen, L.; Schmutz, J.; Grimwood, J.; Dickson, M.; Cooper, G. M.; Stone, E. A.; Asimenos, G.; Brudno, M.; Dutta, A.; Karnani, N.; Taylor, C. M.; Kim, H. K.; Robins, G.; Stamatoyannopoulos, G.; Stamatoyannopoulos, J. A.; Dorschner, M.; Sabo, P.; Hawrylycz, M.; Humbert, R.; Wallace, J.; Yu, M.; Navas, P. A.; McArthur, M.; Noble, W. S.; Dunham, I.; Koch, C. M.; Andrews, R. M.; Clelland, G. K.; Wilcox, S.; Fowler, J. C.; James, K. D.; Groth, P.; Dovey, O. M.; Ellis, P. D.; Wraight, V. L.; Mungall, A. J.; Dhami, P.; Fiegler, H.; Langford, C. F.; Carter, N. P.; Vetrie, D.; Snyder, M.; Euskirchen, G.; Urban, A. E.; Nagalakshmi, U.; Rinn, J.; Popescu, G.; Bertone, P.; Hartman, S.; Rozowsky, J.; Emanuelsson, O.; Royce, T.; Chung, S.; Gerstein, M.; Lian, Z.; Lian, J.; Nakayama, Y.; Weissman, S.; Stolc, V.; Tongprasit, W.; Sethi, H.; Jones, S.; Marra, M.; Shin, H.; Schein, J.; Clamp, M.; Lindblad-Toh, K.; Chang, J.; Jaffe, D. B.; Kamal, M.; Lander, E. S.; Mikkelsen, T. S.; Vinson, J.; Zody, M. C.; de Jong, P. J.; Osoegawa, K.; Nefedov, M.; Zhu, B.; Baxevanis, A. D.; Wolfsberg, T. G.; Crawford, G. E.; Whittle, J.; Holt, I. E.; Vasicek, T. J.; Zhou, D.; Luo, S.; Green, E. D.; Bouffard, G. G.; Margulies, E. H.; Portnoy, M. E.; Hansen, N. F.; Thomas, P. J.; McDowell, J. C.; Maskeri, B.; Young, A. C.; Idol, J. R.; Blakesley, R. W.; Schuler, G.; Miller, W.; Hardison, R.; Elnitski, L.; Shah, P.; Salzberg, S. L.; Pertea, M.; Majoros, W. H.; Haussler, D.; Thomas, D.; Rosenbloom, K. R.; Clawson, H.; Siepel, A.; Kent, W. J.; Weng, Z.; Jin, S.; Halees, A.; Burden, H.; Karaoz, U.; Fu, Y.; Yu, Y.; Ding, C.; Cantor, C. R.; Kingston, R. E.; Dennis, J.; Green, R. D.; Singer, M. A.; Richmond, T. A.; Norton, J. E.; Farnham, P. J.; Oberley, M. J.; Inman, D. R.; McCormick, M. R.; Kim, H.; Middle, C. L.; Pirrung, M. C.; Fu, X. D.; Kwon, Y. S.; Ye, Z.; Dekker, J.; Tabuchi, T. M.; Gheldof, N.; Dostie, J.; Harvey, S. C.

In: Science, Vol. 306, No. 5696, 22.10.2004, p. 636-640.

Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

TY - JOUR

T1 - The ENCODE (ENCyclopedia of DNA Elements) Project

AU - Feingold, E. A.

AU - Good, P. J.

AU - Guyer, M. S.

AU - Kamholz, S.

AU - Liefer, L.

AU - Wetterstrand, K.

AU - Collins, F. S.

AU - Gingeras, T. R.

AU - Kampa, D.

AU - Sekinger, E. A.

AU - Cheng, J.

AU - Hirsch, H.

AU - Ghosh, S.

AU - Zhu, Z.

AU - Patel, S.

AU - Piccolboni, A.

AU - Yang, A.

AU - Tammana, H.

AU - Bekiranov, S.

AU - Kapranov, P.

AU - Harrison, R.

AU - Church, G.

AU - Struhl, K.

AU - Ren, B.

AU - Kim, T. H.

AU - Barrera, L. O.

AU - Qu, C.

AU - van Calcar, S.

AU - Luna, R.

AU - Glass, C. K.

AU - Rosenfeld, M. G.

AU - Guigo, R.

AU - Antonarakis, S. E.

AU - Birney, E.

AU - Brent, M.

AU - Pachter, L.

AU - Reymond, A.

AU - Dermitzakis, E. T.

AU - Dewey, C.

AU - Keefe, D.

AU - Denoeud, F.

AU - Lagarde, J.

AU - Ashurst, J.

AU - Hubbard, T.

AU - Wesselink, J. J.

AU - Castelo, R.

AU - Eyras, E.

AU - Myers, R. M.

AU - Sidow, A.

AU - Batzoglou, S.

AU - Trinklein, N. D.

AU - Hartman, S. J.

AU - Aldred, S. F.

AU - Anton, E.

AU - Schroeder, D. I.

AU - Marticke, S. S.

AU - Nguyen, L.

AU - Schmutz, J.

AU - Grimwood, J.

AU - Dickson, M.

AU - Cooper, G. M.

AU - Stone, E. A.

AU - Asimenos, G.

AU - Brudno, M.

AU - Dutta, A.

AU - Karnani, N.

AU - Taylor, C. M.

AU - Kim, H. K.

AU - Robins, G.

AU - Stamatoyannopoulos, G.

AU - Stamatoyannopoulos, J. A.

AU - Dorschner, M.

AU - Sabo, P.

AU - Hawrylycz, M.

AU - Humbert, R.

AU - Wallace, J.

AU - Yu, M.

AU - Navas, P. A.

AU - McArthur, M.

AU - Noble, W. S.

AU - Dunham, I.

AU - Koch, C. M.

AU - Andrews, R. M.

AU - Clelland, G. K.

AU - Wilcox, S.

AU - Fowler, J. C.

AU - James, K. D.

AU - Groth, P.

AU - Dovey, O. M.

AU - Ellis, P. D.

AU - Wraight, V. L.

AU - Mungall, A. J.

AU - Dhami, P.

AU - Fiegler, H.

AU - Langford, C. F.

AU - Carter, N. P.

AU - Vetrie, D.

AU - Snyder, M.

AU - Euskirchen, G.

AU - Urban, A. E.

AU - Nagalakshmi, U.

AU - Rinn, J.

AU - Popescu, G.

AU - Bertone, P.

AU - Hartman, S.

AU - Rozowsky, J.

AU - Emanuelsson, O.

AU - Royce, T.

AU - Chung, S.

AU - Gerstein, M.

AU - Lian, Z.

AU - Lian, J.

AU - Nakayama, Y.

AU - Weissman, S.

AU - Stolc, V.

AU - Tongprasit, W.

AU - Sethi, H.

AU - Jones, S.

AU - Marra, M.

AU - Shin, H.

AU - Schein, J.

AU - Clamp, M.

AU - Lindblad-Toh, K.

AU - Chang, J.

AU - Jaffe, D. B.

AU - Kamal, M.

AU - Lander, E. S.

AU - Mikkelsen, T. S.

AU - Vinson, J.

AU - Zody, M. C.

AU - de Jong, P. J.

AU - Osoegawa, K.

AU - Nefedov, M.

AU - Zhu, B.

AU - Baxevanis, A. D.

AU - Wolfsberg, T. G.

AU - Crawford, G. E.

AU - Whittle, J.

AU - Holt, I. E.

AU - Vasicek, T. J.

AU - Zhou, D.

AU - Luo, S.

AU - Green, E. D.

AU - Bouffard, G. G.

AU - Margulies, E. H.

AU - Portnoy, M. E.

AU - Hansen, N. F.

AU - Thomas, P. J.

AU - McDowell, J. C.

AU - Maskeri, B.

AU - Young, A. C.

AU - Idol, J. R.

AU - Blakesley, R. W.

AU - Schuler, G.

AU - Miller, W.

AU - Hardison, R.

AU - Elnitski, L.

AU - Shah, P.

AU - Salzberg, S. L.

AU - Pertea, M.

AU - Majoros, W. H.

AU - Haussler, D.

AU - Thomas, D.

AU - Rosenbloom, K. R.

AU - Clawson, H.

AU - Siepel, A.

AU - Kent, W. J.

AU - Weng, Z.

AU - Jin, S.

AU - Halees, A.

AU - Burden, H.

AU - Karaoz, U.

AU - Fu, Y.

AU - Yu, Y.

AU - Ding, C.

AU - Cantor, C. R.

AU - Kingston, R. E.

AU - Dennis, J.

AU - Green, R. D.

AU - Singer, M. A.

AU - Richmond, T. A.

AU - Norton, J. E.

AU - Farnham, P. J.

AU - Oberley, M. J.

AU - Inman, D. R.

AU - McCormick, M. R.

AU - Kim, H.

AU - Middle, C. L.

AU - Pirrung, M. C.

AU - Fu, X. D.

AU - Kwon, Y. S.

AU - Ye, Z.

AU - Dekker, J.

AU - Tabuchi, T. M.

AU - Gheldof, N.

AU - Dostie, J.

AU - Harvey, S. C.

PY - 2004/10/22

Y1 - 2004/10/22

N2 - The ENCyclopedia Of DNA Elements (ENCODE) Project aims to identify all functional elements in the human genome sequence. The pilot phase of the Project is focused on a specified 30 megabases (∼1%) of the human genome sequence and is organized as an international consortium of computational and laboratory-based scientists working to develop and apply high-throughput approaches for detecting all sequence elements that confer biological function. The results of this pilot phase will guide future efforts to analyze the entire human genome.

AB - The ENCyclopedia Of DNA Elements (ENCODE) Project aims to identify all functional elements in the human genome sequence. The pilot phase of the Project is focused on a specified 30 megabases (∼1%) of the human genome sequence and is organized as an international consortium of computational and laboratory-based scientists working to develop and apply high-throughput approaches for detecting all sequence elements that confer biological function. The results of this pilot phase will guide future efforts to analyze the entire human genome.

UR - http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=7444260846&partnerID=8YFLogxK

UR - http://www.scopus.com/inward/citedby.url?scp=7444260846&partnerID=8YFLogxK

U2 - 10.1126/science.1105136

DO - 10.1126/science.1105136

M3 - Review article

C2 - 15499007

AN - SCOPUS:7444260846

VL - 306

SP - 636

EP - 640

JO - Science

JF - Science

SN - 0036-8075

IS - 5696

ER -

The ENCODE (ENCyclopedia of DNA Elements) Project

Abstract

All Science Journal Classification (ASJC) codes

Access to Document

Other files and links

Fingerprint

Cite this